「人を対象とする医学系研究に関する倫理指針」（平成26年文部科学省・厚生労働省告示第3号）は、近年の研究の多様化に伴い、それまで人を対象とする医学系研究の指針とされてきた「疫学研究に関する倫理指針」（平成19年文部科学省・厚生労働省告示第1号）および「臨床研究に関する倫理指針」（平成20年厚生労働省告示第415号）の適用関係が不明確になってきたこと、研究を巡る不正事案が発生したこと等を踏まえ、両指針を統合し制定された。
本指針の主な内容は、
・「研究機関の長及び研究責任者等の責務に関するする規程」
・「バンク・アーカイブに関する規程」
・「研究に関する登録・公表に関する規程」
・「倫理審査委員会の機能強化と審査の透明性の確保に関する規程」
・「インフォームド・コンセント等に関する規程」
・「個人情報等に関する規程」
・「利益相反の管理に関する規程」
・「研究に関する資料・情報等の保管に関する規程」
・「モニタリング・監査に関する規程」
・「施行日」
の10項目で構成されている。
本指針は、日本で人を対象とした医学系研究をする際は、把握しておくべき指針の一つである。